Yûgi désigne en fait deux personnages (2 âmes) qui partagent le même corps. Le propriétaire du corps est Yûgi Mutô. Le jour où il réussit à compléter un puzzle millénaire offert par son grand-père, une seconde âme vient habiter son corps. D'abord totalement séparées et n'ayant aucun moyen de communiquer, les 2 âmes trouvent finalement un moyen pour devenir partenaires.

Katsuya Jono-Uchi ou Joey Wheeler est le meilleur ami de Yûgi Mutô. Il le protègera face aux dangers. C'est aussi un duelliste et un grand défenseur de l'amitié. Il était un garçon bagarreur et redoutable, membre d'une bande de voyous. Tout bagarreur qu'il est, il a le sens de l'honneur et n'a jamais malmené plus faible que lui. Enfant d'un couple divorcé, il vit chez son père chômeur, alcoolique et violent. Il a une jeune soeur, Shizuka, qui vit avec sa mère. Très pauvre, il combine son emploi de temps au lycée avec divers petits jobs, notamment livreur de journaux pour assumer ses finances. Il fit plus tard la rencontre de Honda qui devint son très proche ami, période durant laquelle il cessa sûrement de traîner avec des bandes de voyous, même si avec Honda, il gardait sa mentalité de voyou bagarreur. Lui et Honda avaient l'habitude d'ennuyer Yûgi un jeune garçon chétif et peureux de leur classe, non pas dans le but de le blesser, mais plutôt d'en faire un homme. C'est le jour ou Yûgi s'interposera entre lui et une grande brute qui le menaçait qu'il prit conscience d'une grande amitié et ils devinrent inséparables.

Anzu Mazaki ou Téa Gardner accompagne Yûgi, Jono-Uchi et Honda dans leurs aventures.

Anzu est une amie d'enfance de Yûgi. Son deck est composé de monstres féminins (comme la Magicienne de la Foi et la Sorcière du Feu). Elle se bat seulement contre Mai Valentine (voir Mai Kujaku) au Royaume des Duellistes et contre le Pingouin du Cauchemar dans les épisodes 102 et 103.

Anzu aidera Atem à retrouver sa mémoire en compagnie de Yûgi. Enfin, Anzu est passionnée de danse et rêve d'en faire son métier. Pour cela, elle travaille dans un fast-food après les cours, afin de financer ses futures études aux États-Unis.

Hiroto Honda ou Tristan est l'ami de Joey. Ils se connaisent depuis longtemps. Comme Joey, il a appris a respecter Yugi et à devenir son ami.

Seto Kaiba est le principal rival de Yûgi Muto dans le manga et le dessin animé Yu-Gi-Oh!, de Kazuki Takahashi. Il est le P.D.G de la Kaiba Corporation, multinationale spécialisée dans les jeux de haute technologie. Néanmoins, au fur et à mesure du manga, il tend à devenir un personnage au rôle plus instable, étant tantôt un allié tantôt un ennemi de Yugi.

Mokuba Kaiba est le frère de Seto Kaiba. Il aide souvent son frère grâce aux nouvelles technologies développées par la Kaiba Corp . Son nom est Makuba Kaiba dans la version française du dessin animé.